技术平台

• 建成一个含10万个以上独立转化子的突变体库。
• 对10,000以上的转基因株系系统地进行增强子的检测。
• 分离40,000个以上突变体插入位点的侧翼DNA序列。
• 获得一个包含30,000以上非冗余序列cDNA序列数据库及其相对应的cDNA克隆。
• 获得5,000条非冗余基因的全长cDNA及相对应的序列。
• 规范地建立起我国包括20,000以上非冗余序列水稻cDNA芯片体系。
• 一个能完成上述各种研究的数据采集、进行本地化分析的各种数据库和各种分析的生物信息体系。

重要性状的功能基因组

• 鉴定出一批形态性状的突变体；筛选出一批不同组织、器官和生长期时期特异表达外源基因的“模式系”。
• 筛选出一批对水稻育种有价值的重要性状（如抗旱、抗病、抗虫、营养高效、根系形态、稻米品质等）的突变体。
• 应用cDNA芯片的方法建立相对性状的基因表达谱，确定相对性状特异性的生化过程和代谢通路。并在此基础上分离出500个以上相对性状特异表达的基因序列。

功能基因的分离克隆

• 分离200以上明确功能的特异表达基因和调控因子。
• 分离出30个以上重要性状的功能基因，其中5-10个基因具有明显的育种应用前景。
  与参加本“重大专项”的兄弟单位所承担的工作加在一起，本项目将是目前国际上规模最大、水平最高的水稻功能基因组研究工作，项目的完成将使我国的水稻功能基因组研究在国际上处于领导地位。